في أعقاب إغلاق ملفات الإكس، تم تعيين سكالي في أكاديمية مكتب التحقيقات الفيدرالي بينما حصل مولدر على شريك جديد. لكن كلاهما عاد إلى عالم ما وراء الطبيعة عندما اختطفت الكائنات الفضائية سكالي، وظهرت امرأة تدعي أنها أخت مولدر المفقودة للمساعدة في قضية.